Javna ustanova More i krš osnovana je s ciljem očuvanja, zaštite i promicanja prirodnih vrijednosti Splitsko-dalmatinske županije. Od svog osnutka do danas, Ustanova razvija i provodi mjere zaštite prirode te upravlja zaštićenim područjima na kopnu i moru, koja čine jedinstvenu prirodnu i kulturnu baštinu.

Morski ekosustavi iznimno su osjetljivi i važni za očuvanje biološke raznolikosti. More i krš brine se o očuvanju staništa brojnih rijetkih i endemskih vrsta, nadzire njihovo stanje te osigurava da se prirodni procesi odvijaju nesmetano. Istodobno radi na edukaciji javnosti i podizanju svijesti o važnosti održivog odnosa prema prirodi i moru. 

Pod upravljanjem Javne ustanove nalazi se niz zaštićenih lokaliteta, 4 posebna rezervata, 13 spomenika prirode, 14 značajnih krajobraza i 8 spomenika parkovne arhitekture, te područje ekološke mreže Natura 2000 u Splitsko-dalmatinskoj županiji.

Površina ekološke mreže Natura 2000 u Splitsko-dalmatinskoj županiji iznosi 280.164,37 ha (cca 20% površine Splitsko-dalmatinska županije) od čega 99.281,840 ha pripada morskom dijelu. Na području Županije nalazi se 6 područja očuvanja značajnih za ptice (POP) te 142 područja očuvanja značajnih za vrste i stanišne tipove (POVS).

Od morskih zaštićenih područja možemo spomenuti posebne rezervate: Pantan i Stupišće, vrijedni zbog jedinstvenih ekosustava i bioraznolikosti. 

Pantan je priobalna boćata močvara. Rijeka, trščak, laguna i sprudovi su glavni elementi. Laguna (donekle i obližnje more) ima specifičan režim saliniteta i temperature, što uvjetuje sastav ihtiofaune. Sprudovi štite i odvajaju lagunu od mora, zbog čega su iznimno važni, a ujedno mogu biti gnjezdilišta nekih važnijih ptičjih vrsta.

Posebni rezervat Rt Stupišće prvo je strogo zaštićeno morsko područje u Splitsko-dalmatinskoj županiji. Smješten je nedaleko od Komiže, a zbog svojih koraligenskih strmaca bogatih bioraznolikošću, kao i olupine parobroda Vassilios T., dobro je poznat svim ljubiteljima mora, podvodne arheologije i ronjenja. Zaštićeno područje obuhvaća 109,76 ha, od čega 94,43 ha (93,7 %) otpada na more. Podmorje ispred rta Stupišće je iznimno bogato biljnim i životinjskim vrstama.

Spomenici prirode, morske špilje Modra, Zelena i Medvidina, prepoznatljivi su simboli prirodne i geološke posebnosti Jadrana, čarobni podzemni svjetovi u kojima svjetlost i more stvaraju nezaboravne prizore.

Kroz sustavno praćenje, nadzor i suradnju s lokalnim zajednicama, Ustanova radi na usklađivanju zaštite prirode i održivog korištenja resursa, čime doprinosi očuvanju prirodne baštine Splitsko-dalmatinske županije i jačanju identiteta Jadrana kao regije iznimne bioraznolikosti.